Presentations - YURA Kei
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鳥類大脳におけるアストロサイト発生機構の解明
土井泉璃、隈元拓馬、由良敬、青田伊莉安、原雄一郎、丸山千秋, Domestic, Poster presentation, 2025.03, 2025/03/142025/03/15, 第18回神経発生討論会, 滋賀医科大学, Not Invited, Coauthor
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全ゲノムリシーケンスとメチローム解析によるジャニンジン野生系統の局所適応の解明
木下舞香、佐川千理、内藤健、伊藤佑、佐々木卓、本庄三恵、工藤洋、植村知博、由良敬、岩崎貴也, Domestic, Poster presentation, 2025.03, 2025/03/072025/03/07, 日本植物分類学会第24回大会, 高知大学朝倉キャンパス, 日本植物分類学会, Not Invited, Coauthor
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Characterization of a novel nuclear protein of the SAP130/CPSF160/DDB1 family
Cyrose Suzie SILVOSA-MILLADO, 由良 敬, Vicente RUBIO, 加藤真理子、柘植 知彦, Domestic, Poster presentation, 2024.12, 2024/12/152024/12/16, 第12回 植物RNA研究者ネットワークシンポジウム, 佐賀大学本庄キャンパス, Not Invited, Coauthor
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染色体レベル全ゲノム塩基配列と多組織トランスクリプトームに基づくコオロギにおける性特異的発現遺伝子と性的二型の進化
三野流斗, 阿左美優花、早川翔大、平田和也、里村和浩、内藤健, 鈴木丈詞、由良敬, 朝日透, 片岡孝介, Domestic, Poster presentation, 2024.11, 2024/11/272024/11/29, 第47回 日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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Thermus thermophilus にある特殊ポリアミンの生合成経路に関する情報探索
池島日向子、馬渕美玲、由良敬, Domestic, Poster presentation, 2024.11, 2024/11/272024/11/29, 第47回 日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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鳥類大脳におけるアストロサイト産生メカニズムの解析
土井泉璃、隈元拓馬、由良敬、丸山千秋, Domestic, Poster presentation, 2024.11, 2024/11/272024/11/29, 第47回 日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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メタゲノムショットガン解析によるコオロギ腸内細菌叢の性的二型および交尾後の変化の探索
平田 和也, 細川 正人, 鈴木 丈詞, 由良 敬, 朝日 透, 片岡 孝介, Domestic, Poster presentation, 2024.11, 2024/11/272024/11/29, 第47回 日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡, Not Invited, Coauthor
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森林型・海浜型のジャニンジン種内系統についての全ゲノム解析による環境適応遺伝子候補の探索
佐川千理、木下舞香、内藤健、本庄三恵、工藤洋、植村知博、由良敬、岩崎貴也, Domestic, Poster presentation, 2024.09, 2024/09/132024/09/16, 日本植物学会第88回大会, 宇都宮大学 陽東キャンパス, 日本植物学会, Not Invited, Coauthor
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Metagenomic Perspective into Sexual Dimorphism of Gut Bacteriome in the Field Cricket Teleogryllus occipitalis
Kazuya Hirata, Masahito Hosokawa, Takeshi Suzuki, Kei Yura, Toru Asahi, Kosuke Kataoka, Domestic, Oral presentation (general), 2024.08, 2024/08/212024/08/24, 2nd Non-Traditional Arthropod Model Systems, Waseda University, Not Invited, Coauthor
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Insight into Sexual Dimorphism from Chromosome-level Genome Assemblies of the Crickets (Orthoptera: Gryllidae)
Ryuto Sanno, Yuka Azami, Shota Hayakawa, Kazuya Hirata, Ken Naito, Takeshi Suzuki, Kei Yura, Toru Asahi, Kosuke Kataoka, Domestic, 2024.08, 2024/08/212024/08/24, 2nd Non-Traditional Arthropod Model Systems, Waseda University, Not Invited, Coauthor
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Genetic Insights into the Biosynthetic Pathway of Taurine in the Cricket Superfamily
Aina Suzuki, Haruno Horiuchi, Kohyoh Murata, Teikichi Ikura, Ryuto Sanno, Kousuke, Domestic, Oral presentation (general), 2024.08, 2024/08/212024/08/24, 2nd Non-Traditional Arthropod Model Systems, Waseda University, Not Invited, Coauthor
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Transport of serum amyloid P component to brain induces age-related neurodegeneration in senescence-accelerated mouse P8
Fuka Sato, Ai Fujii, Saki Katagiri, Masaki Ishikawa, Daisuke Nakajima, Ryo Konno, Yusuke Kawashima, Keiichi Nakagawa, Toshiaki Ishizuka, Kei Yura, Mari Gotoh, Yasunori Miyamoto, Kei Hashimoto, Domestic, Poster presentation, 2024.07, 2024/07/242024/07/27, NEURO2024, Fukuoka Convention Center, Not Invited, Coauthor
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Quantitative Description and Investigation into the Mechanism of Gravitactic Swimming Behavior in Coral Larvae
Asuka TKEDA-SAKAZUME,Junko HONJO, Sachia SASANO,Kanae MATSUSHIMA2Yuuko WADA,Minori OSHIMA, Shoji A BABA, Kei YURA, Yoshihiro MOGAMI, Masayuki HATTA, Domestic, Poster presentation, 2024.06, 2024/06/242024/06/28, IUPAB2024, Kyoto International Conference Hall, IUPAB, Not Invited, Coauthor
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AtCFIはmRNAの 3'UTR多様性を担保する
張 暁娟, Łukasz SZEWC, Mateusz BAJCZYK, David BIELEWICZ, 由良 敬, 大土井 実郁, Cyrose Suzie SILVOSA-MILLADO, 加藤 真理子, Marta Garcia-LEÓN, Vicente RUBIO, 野元 美佳, 多田 安臣, 古本 強, Zofia SZWEYKOWSKA-KULINSKA, ..., Domestic, Oral presentation (general), 2024.03, 2024/03/142024/03/16, 第66回日本植物生理学会, 金沢大学角間キャンパス, 日本植物生理学会, Not Invited, Coauthor
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Dark Enzymes Dark Proteinsに光を当てるために
由良敬, Domestic, Oral presentation (invited, special), 2023.12, 2023/12/272023/12/27, 第23回名古屋大学遺伝子実験施設公開セミナー, 名古屋大学オークマ工作機械工学館オークマホール, 名古屋大学遺伝子実験施設, Invited, Main Speaker
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コオロギ上科におけるタウリン生合成経路の探索
2. 鈴木愛菜, Domestic, Poster presentation, 2023.12, 2023/12/062023/12/08, 第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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大脳皮質第5層錐体細胞におけるシナプス入力の時空間的クラスタリングと入力同時性検出機能の関係解析
徳田椋子, Domestic, Poster presentation, 2023.12, 2023/12/062023/12/08, 第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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コオロギ科の染色体レベル全ゲノム塩基配列に基づく性分化機構の解明
三野流斗, Domestic, Poster presentation, 2023.12, 2023/12/062023/12/08, 第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 日本分子生物学会, Not Invited, Coauthor
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Data integration platform for extracting new knowledge from Thermus thermophilus
Kei Yura, International, Oral presentation (invited, special), 2023.11, 2023/10/302023/11/02, 第96回日本生化学会大会, 福岡国際会議場, 日本生化学会, Invited, Main Speaker
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ThermusQ knowledgebase toward the cell simulation platform for Thermus thermophilus
Atsushi Hijikata, International, Poster presentation, 2023.10, 2023/10/272023/10/28, International Workshop on "Neotechnologies for ThermusQ initiative", Atagawa Onsen, Japan, ThermusQ研究会, Not Invited, Coauthor
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ThermusQ: An integrated website for Thermus thermophilus data
Kei Yura, International, Oral presentation (invited, special), 2023.10, 2023/10/272023/10/28, International Workshop on "Neotechnologies for ThermusQ initiative", Atagawa Onsen, Japan, ThermusQ研究会, Invited, Main Speaker
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In Search of Proteins for Polyamine Biosynthetic Pathway Out of Dark Enzymes Encoding in Thermus thermophilus Genome
Hinako Ikeshima, International, 2023.10, 2023/10/272023/10/28, International Workshop on "Neotechnologies for ThermusQ initiative", Atagawa Onsen, Japan, ThermusQ研究会, Not Invited, Coauthor
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老化促進マウスSAMP8における認知障害誘発機構の解明
橋本恵, Domestic, Poster presentation, 2023.08, 2023/08/262023/08/27, 第41回日本ヒト細胞学会学術集会, ウェスタ川崎多目的ホールA, 日本ヒト細胞学会, Not Invited, Coauthor
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CRISPOR_Insect: Toward the Development of gRNA Design Tool Specialized for Cricket Genomes
Teikichi Ikura, International, Poster presentation, 2023.08, 2023/08/012023/08/04, Non-Traditional Arthropod Model Systems: Studying Form and Function, Bowdoin College, Brunswick, Maine, USA, Not Invited, Coauthor
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Amino acid coevolution reveals novel monomer conformations in DNA-binding response regulators
Mayu Shibata, International, Poster presentation, 2023.06, 2023/06/042023/06/08, Genome Architecture and Function Workshop 2023, Hotel Balkan, Sofia, Not Invited, Coauthor
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1細胞/微小組織マルチオミックスのオールインワン解析による生命科学研究支援
由良敬, Domestic, Oral presentation (invited, special), 2022.10, 2022/10/252022/10/27, CBI学会2022年大会, タワーホール船堀、東京, CBI学会, Invited, Main Speaker
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生命科学データベースを接続したVaProSによるデータ解析
由良 敬, Domestic, 2018.11, , 第41回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜会議センター、神奈川、日本, 日本分子生物学会, Invited, Main Speaker
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ホタルイカのゲノムデータ解析による発光タンパク質の推定
川井 優里、舟橋 実里、由良 敬, Domestic, 2018.10, , 第一回イカ・タコ研究会, 島根大学 隠岐海浜実験所, イカ・タコ研究会, Not Invited, Main Speaker
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創薬等ライフサイエンス研究を促進する研究支援とデータサイエンス
由良 敬, Domestic, 2018.10, , CBI学会2018年度大会, タワーホール船堀、東京、日本, CBI学会, Invited, Main Speaker
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生命科学データベースの接続をめざすVaProSから見えてくるあらたな知見
由良 敬, Domestic, 2018.09, , 第56回日本生物物理学会, 岡山大学津山キャンパス、岡山、日本, 日本生物物理学会, Invited, Main Speaker
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生命科学データベースの接続(VaProS)から見えてくる知見
由良 敬, Domestic, 2017.12, , 2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017), 神戸ポートアイランド、兵庫、日本, 日本分子生物学会, Not Invited, Main Speaker
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The effect of variation of nucleotides on protein three-dimensional structures and on their function-a couple of case studies
YURA Kei, International, 2017.09, , International Symposium on Genome Science, Vietnam Academy of Science and Technology ,Hanoi,Vietnam, Vietnam Academy of Science and Technology ,Hanoi,Vietnam, Not Invited, Main Speaker
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構造生命科学データクラウドVaProSとその適用事例
由良 敬, Domestic, 2017.07, , 第386 回情報計算化学生物学会(CBI学会)講演会, 東京工業大学キャンパスイノベーションセンター、東京、日本, CBI学会, Invited, Main Speaker
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タンパク質立体構造に見られる塩基多様性の影響−数例のケーススタディーから−
由良 敬, Domestic, 2017.05, , NGS現場の会第5回研究会, 仙台国際センター、仙台、日本, NGS現場の会, Invited, Main Speaker
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プリン生合成系の成り立ち—全酵素の俯瞰的な構造比較から—
塩生 真史、郷 通子、由良 敬 , Domestic, 2016.12, , 第39 回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜, 日本分子生物学会, Invited, Main Speaker
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タンパク質複合体界面における「からまった」構造は何を意味するのか?
由良 敬、中川 真理子、ヘイワード・スティーブン, Domestic, 2016.09, , 日本生化学会大会, 仙台, 日本生化学会, Invited, Main Speaker
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ラン藻プロテオームの立体構造は どこまでわかったか?
岩崎 愛、由良 敬, Domestic, 2016.06, , ラン藻ゲノム交流会2016, 東京大学駒場キャンパス、東京, ラン藻ゲノム交流会, Invited, Main Speaker
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配列から機能まで、統合解析のためのVapRoS
由良 敬, Domestic, 2016.03, , 日本農芸化学会2016年度大会, 札幌, 日本農芸化学会, Invited, Main Speaker
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Improvement in the prediction of RNA interface in RNA-binding protein
YURA Kei, Domestic, 2015.09, , The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Kanazawa University, Kanazawa, Japan, the Biophysical Society of Japan, Invited, Main Speaker
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タンパク質の立体構造予測の現状と課題
由良 敬, Domestic, 2015.06, , 第364回CBI学会講演会, 東京工業大学キャンパスイノベーションセンター、東京, 情報計算化学生物会, Invited, Main Speaker
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Prediction and its application of N-linked glycosylation sites from amino acid sequences
HIRANO Yuki, YURA, Kei, International, 2015.05, , 9th Asian Biophysics Association Symposium, Hangzhou, China, the Biophysical Society of China, Not Invited, Coauthor
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A simple statistical potential for protein complex structure prediction and its application to protein-docking problems
YURA Kei, Domestic, 2015.03, , Analysis and prediction of protein assembly structures by bioinformatics, Osaka, Japan, Institute for Protein Research, Osaka University, Invited, Main Speaker
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ゲノム塩基配列の変異と表現系の変化を つなぐタンパク質立体構造の変化
由良 敬・照井 宏子, Domestic, 2015.03, , 日本農芸化学会 2014年度大会, 明治大学生田キャンパス、東京, 日本農芸化学会, Invited, Main Speaker
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データクラウドを用いた構造生命科学:その開発と利用
由良 敬, Domestic, 2015.02, , 創薬につなぐ日本の創薬基盤技術, 東京国際フォーラム、東京, 創薬等支援技術基盤プラットフォーム事務局, Invited, Main Speaker
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遺伝的変異の影響を タンパク質の構造から推定する
由良 敬・照井 宏子, Domestic, 2014.02, , 第32回白金シンポジウム, 北里大学薬学部コンベンションホール、東京, 北里大学薬学部, Invited, Main Speaker
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3DRareVariantがめざす タンパク質構造の創薬等への応用
由良 敬, Domestic, 2013.09, , 第1回創薬等支援技術基盤プラットフォーム 公開シンポジウム, 東京, 創薬等支援技術基盤プラットフォーム推進委員長, Invited, Main Speaker
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Prediction of DNA-binding Sites on Transcription Factors and Their Target DNA Sequences
NUMAZAWA Ayumi, YURA Kei, International, 2013.05, , 8th Asian Biophysics Association Symposium, Jeju-do Korea, Korean Biophysical Soceity, Invited, Main Speaker
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A trial to predict DNA-binding residues and their target sequences of transcription factors
NUMAZAWA Ayumi, YURA Kei, Domestic, 2012.09, , The 2nd Annual Meeting for the Whole-Organism Science Society, Public Relations Center, SPRing 8, Harima, Japan, the Whole-Organism Science Society, Invited, Main Speaker
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ハプティクスを用いてタンパク質を触ることからわかること
Kei Yura, Domestic, 2011.11, , CBI学会研究講演会「蛋白質のかたちと創薬 - 3次元分子模型とVR 技術を通じた分子設計に向けて」, Ochanomizu University, CBI 学会, Invited, Main Speaker
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Prediction of Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and Modeled 3D-Structures
Kei Yura, International, 2011.10, , The 17th International Biophysics Congress (IUPAB), Beijing, China, International Union for Pure and Applied Biophysics, Invited, Main Speaker
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Prediction of protein function utilizing its structural information
Kei Yura, Domestic, 2011.09, , The 84th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society, Kyoto International Conference Center, the Japanese Biochemical Society, Invited, Main Speaker
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ALAdeGAPチームのCASP9参加報告
Kei Yura, Domestic, 2011.02, , CASP9特集 タンパク質立体構造予測の最新動向, 東京工業大学 蔵前会館ロイヤルブルーホール, 並列生物情報イニシアティブ(IPAB), Invited, Main Speaker
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The interwinding nature of protein-protein interfaces and its implication for protein complex formation
Kei Yura, International, 2011.01, , 7th Asian Biophysics Association Symposium, India Habitat Center, New Delhi, India, Asian Biophysics Association, Invited, Main Speaker
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The interwinding nature of protein-protein interfaces and its implication for protein complex formation
Kei Yura, Domestic, 2010.09, , 天然変性タンパク質の構造,物性,機能、第48回日本生物物理学会年会シンポジウム, Tohoku University, 日本生物物理学会, Invited, Main Speaker
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RNA 結合タンパク質の結合界面を予測する
Kei Yura, Domestic, 2010.09, , 新しいRNA/RNPを見つける会, Hirosaki, 新しいRNA/RNPを見つける会, Invited, Main Speaker
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Building a Database for Deinococcus and Thermus Comparative Genomic Analyses
Kei Yura, Domestic, 2010.08, , 高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第9回連携研究会, Harima, RIKEN, Harima, Invited, Main Speaker
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植物オルガネラにおけるRNAエディティング:タンパク質立体構造との関係とエディティング部位の予測
Kei Yura, Domestic, 2010.08, , ゲノム進化学の新展開、日本進化学会2010年大会ワークショップWS10, 東京工業大学大岡山キャンパス, 日本進化学会, Invited, Main Speaker
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Prediction of Interfaces for Molecules on Protein Surfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures
Kei Yura, International, 2010.05, , 第十五屆生物物理聯合研討會, 中央研究院生物醫學科學研究所、台湾, 台湾生物物理学會, Invited, Main Speaker
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Beyond Omics
kei Yura, International, 2010.01, , Japanese-French Frontiers of Science Program, Futuroscope, France, JSPS, Invited, Main Speaker
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Bioinformatics Course for Undergraduate in Ochanomizu University and Our Recrnt Work on Structural Bioinformatics: The Interwinding Nature of Protein-Protein Interfaces and Its Implication for Protein Complex Formation
Kei Yura, Domestic, 2009.12, , Workshop: Bioinformatics beyond Omics Data Analyses, Tokyo, Center for Informational Biology, Ochanomizu University, Invited, Main Speaker
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デイノコッカス・ラジオデュランスの放射線抵抗性に関与する遺伝子探索
Kei Yura, Domestic, 2009.10, , ポストゲノムシーケンス時代:機能未知タンパク質群の機能発見のチャンス到来!, 第82回日本生化学会大会シンポジウム, 神戸, 日本生化学会, Invited, Main Speaker
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Homology Modeling Method
Kei Yura, International, 2009.09, , Asian Workshop for Protein Structure Prediction Methodology, KIAS, Souel, Korea, KIAS, Korea, Invited, Main Speaker
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機能未知タンパク質の機能を計算機でどうやって明らかにしていくか
Kei Yura, Domestic, 2009.08, , 高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第8回連携研究会, Harima, RIKEN, Harima, Invited, Main Speaker
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The interwinding nature of protein-protein interfaces and its implication for protein complex formation
Kei Yura, Domestic, 2009.07, , International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function, University of Tokyo, JST, Invited, Main Speaker
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ナンジャモンジャゴケ葉緑体ゲノムデータに基づくRNAエディティング部位の予測
Kei Yura, Domestic, 2009.05, , プロテイン・インフォマティクス:蛋白質科学のためのバイオインフォマティクス、第9回日本蛋白質科学会年会ワークショップ, 熊本, 日本蛋白質科学会, Invited, Main Speaker
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Diversification of protein repertoire by alternative splicing
Kei Yura, International, 2009.05, , 第66回韓国生化学及び分子生物学会年会シンポジウム, COEX, Souel, Korea, 韓国生化学及び分子生物学会, Invited, Main Speaker
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たくさんのデータ観察からわかるタンパク質が低分子を認識するようす
由良敬, Domestic, 2009.03, , 第3回お茶の水女子大学糖鎖科学研究教育センター公開シンポジウム「糖鎖が語る生命と病気」, Tokyo, お茶の水女子大学糖鎖科学研究教育センター, Invited, Main Speaker
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Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein And Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures
Kei Yura, Domestic, 2009.03, , ATI International Forum 2009 "Protein Structure Determination and Applications", 東海村, ATI, Invited, Main Speaker
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Prediction of interface residues on proteins for RNA and protein molecules
Kei Yura, International, 2009.02, , Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences - Experiments and Simulations, Soeul, Korea, KIAS, Korea, Invited, Main Speaker
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Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures
Kei Yura, Domestic, 2008.12, , Frontiers of Computational Biology on Protein Structures, Tokyo, Center for Informational Biology, Ochanomizu University, Invited, Main Speaker
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Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures
Kei Yura, Domestic, 2008.11, , International Symposium on Frontiers of Computational Science, Nagoya, Nagoya University, Invited, Main Speaker
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Education and Researches in Interdisciplinary Areas: Life Science, Information Science and Nanotechnology
Kei Yura, International, 2008.11, , 日本-アジアの『知』の融和-第一回国際フォーラム in Bangkok,, Bangkok, Thailand, Ochanomziu University, Invited, Main Speaker
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Finding different types of characteristics in protein-protein interfaces for interface prediction
Kei Yura, Domestic, 2008.09, , Japan-UK Symposium on Protein Informatics toward Interactome Analysis, Senri, Osaka, Osaka University, Invited, Main Speaker
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生命情報学教育研究センターの発足
Kei Yura, Domestic, 2008.09, , シンポジウム:「若手と女性が活躍するお茶大型システム~新たな拠点と9人の自立的研究者~」, Tokyo, Ochanomizu University, Invited, Main Speaker
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Information Flow from DNA Sequence to Protein Function
Kei Yura, International, 2008.06, , Science in Japan Forum 2008 "Interaction of Physics and Biology", Washington DC, USA, JSPS, Invited, Main Speaker
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植物オルガネラのRNAエディティングにみる進化の戦略
Kei Yura, Domestic, 2008.06, , タンパク質の戦略~自然のデザインと人知のデザイン, 第8回日本蛋白質科学会年会ワークショップ, Tokyo, 日本蛋白質科学会, Invited, Main Speaker
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タンパク質の構造とアミノ酸配列にもとづく相互作用予測
Kei Yura, Domestic, 2008.03, , 第8回生物物理学的アプローチによるゲノム情報解析研究会-ゲノム生物物理学の未来-, Nagoya University, Aichi Science and Technology Foundation, Invited, Main Speaker
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DNA修復促進タンパク質PprAの構造と機能の推定
Kei Yura, Domestic, 2008.03, , 日本原子力研究開発機構生命科学研究シンポジウム2008, 御茶ノ水, 日本原子力研究開発機構, Invited, Main Speaker
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タンパク質の立体構造にもとづく相互作用構造の推定
Kei Yura, Domestic, 2008.03, , バイオインファーマティクスの薬学研究・薬学教育への応用と展開, 第128会日本薬学会年会・日本学術会議薬学委員会共催シンポジウム, パシフィコ横浜, 日本薬学会, Invited, Main Speaker