論文 - 由良　敬

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  1. Chromosome-scale whole genome assembly and annotation of the Jamaican field cricket Gryllus assimilis

    Scientific Data, Springer-Nature, 12巻(頁826 - ), 2025年05月, Yuki Ito, Ryuto Sanno, Seiya Ashikari, Kei Yura, Toru Asahi, Guillem Ylla,Kosuke Kataoka, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  2. Applicability of the regression approach for histological multi-class grading in clear cell renal cell carcinoma

    Regenerative Therapy, Elsevier, 28巻(頁431 - 437), 2025年03月, Mayu Shibata, Akihiro Umezawa, Saki Aoto, Kohji Okamura, Michiyo Nasu, Ryuichi Mizuno, Mototsugu Oya, Kei Yura, Shuji Mikami, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  3. Identification of novel Golgi-localized putative glycosyltransferase protein in Arabidopsis thaliana

    Plant Biotechnology, , 41巻1号(頁35 - 44), 2024年03月, Natalia Rzepecka, Yoko Ito, Kei Yura, Emi Ito, Tomohiro Uemura, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  4. シングルセル/微小組織マルチオミクス解析

    実験医学, 羊土社, 42巻2号(頁199 - 204), 2024年01月, 由良敬、松永浩子、細川正人、和泉自泰、村松知成、福永津嵩、浜田道昭、馬場健史、竹山春子, 総説, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

  5. Residue coevolution and mutational landscape for OmpR and NarL response regulator subfamilies

    Biophysical Journal, , 123巻6号(頁681 - 692), 2024年01月, Mayu Shibata, Xingcheng Lin, José N. Onuchic, Kei Yura, Ryan R. Chen, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  6. Complete mitochondrial genome sequences of two ground crickets, Dianemobius fascipes nigrofasciatus and Polionemobius taprobanensis (Orthoptera: Grylloidea: trigonidiidae)

    Mitochondrial DNA Part B, , 8巻12号(頁1311 - 1315), 2023年12月, Kohyoh Murata, Kosuke Kataoka, Ryuto Sanno, Kazuhiro Satomura, Atsushi Ogura, Toru Asahi, Kei Yura, Takeshi Suzuki, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  7. ThermusQ: Toward the cell simulation platform for Thermus thermophilus

    Journal of General and Applied Microbiology, Applied Microbiology, Molecular and Cellular Biosciences Research Foundation, 69巻2号(頁59 - 67), 2023年09月, Atsushi Hijikata, Tairo Oshima, Kei Yura, Yoshitaka Bessho, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  8. Isolation and genomic analysis of a type IV pili-independent Thermus thermophilus phage, φMN1 from a Japanese hot spring

    Journal of General and Applied Microbiology, Applied Microbiology, Molecular and Cellular Biosciences Research Foundation, 69巻2号(頁117 - 124), 2023年07月, Masatada Tamakoshi, Atsushi Hijikata, Kei Yura, Kenshiro Oshima, Hidehiro Toh, Kaoru Mitsuoka, Tairo Oshima, Yoshitaka Bessho, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  9. Whole genome analyses for c-type cytochromes associated with respiratory chains in the extreme thermophile, Thermus thermophilus

    Journal of General and Applied Microbiology, Applied Microbiology, Molecular and Cellular Biosciences Research Foundation, 69巻2号(頁68 - 78), 2023年06月, Koyu Hon-nami, Atsushi Hijikata, Kei Yura, Yoshitaka Bessho, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  10. A trial of web-based method to teach impact of genome variation on protein structures at high school

    Natural Science Report, Ochanomizu University, お茶の水女子大学, 73巻1-2号(頁13 - 21), 2023年03月, Saki Katagiri, Mayu Shibata, Misae Kudo, Kei Yura, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  11. PGLN: A newly identified amino phosphoglycolipid species in Thermus thermophilus HB8

    Biochemistry and Biophysics Reports, Elsevier B.V., 32巻(頁101377 - ), 2022年12月, Naoki Nemoto, Masahiko Kawaguchi, Kei Yura, Haruo Shimada, Yoshitaka Bessho, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  12. Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral

    Microbiome, Springer Nature, 10巻(頁220 - ), 2022年12月, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano, Koji Kinjo, Michihiro Ito, Masahito Hosokawa, Kei Yura, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  13. O3C Glass-Class: A machine learning framework for prognostic prediction of ovarian clear cell carcinoma

    Bioinformatics and Biology Insights, SAGE Journal, 16巻(頁11779322221134312 - ), 2022年11月, Ryo Yokomizo, Tiago J.S. Lopes, Nagisa Takashima, Sou Hirose, Ayako Kawabata, Masataka Takenaka, Yasushi Iida, Nozomu Yanaihara, Kei Yura, Haruhiko Sago, Aikou Okamoto, Akihiro Umezawa, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  14. Validation of the application of gel beads-based single-cell genome sequencing platform to soil and seawater

    ISME Communications, Springer Nature, 2巻1号(頁92 - ), 2022年09月, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ryota Wagatsuma, Katsuhiko Mineta, Kai Takahashi, Keigo Ide, Kei Yura, Hayedeh Behzad, Takashi Gojobori, Haruko Takeyama, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  15. Computational study of the impact of nucleotide variations on highly conserved proteins: In the case of actin

    Biophysics and Physicobiology, 日本生物物理学会, 19巻1号(頁e190025 - ), 2022年07月, Ha T. T. Duong, Hirofumi Suzuki, Saki Katagiri, Mayu Shibata, Misae Arai, Kei Yura, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  16. 日本語版健常者病気認知尺度:遺伝性疾患への適用の検討

    日本遺伝カウンセリング学会誌, , 43巻1号(頁47 - 52), 2022年05月, 甲畑(照井)宏子・由良　敬・池田まさみ, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  17. Co-expression network analysis of environmental canalization in the ascidian Ciona

    BMC Ecology and Evolution, , 22巻(頁53), 2022年04月, Atsuko Sato, Gina M Oba, Nathanael Aubert-Kato, Kei Yura, John Bishop, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  18. Single-cell metabolite detection and genomics reveals uncultivated talented producer

    PNAS nexus, , 1巻1号(頁pgab007), 2022年03月, Masato Kogawa, Rimi Miyaoka, Franziska Hemmerling, Masahiro Ando, Kei Yura, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Yuji Ise, Jackson K B Cahn, Kentaro Takada, Shigeki Matsunaga, Tetsushi Mori, Jörn Piel, Haruko Takeyama , 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

  19. Protein Data Bank Japan: Celebrating our 20th anniversary during a global pandemic as the Asian hub of 3D macromolecular structural data

    Protein Science, , 31巻1号(頁173 - 186), 2022年01月, Gert-Jan Bekker, Masashi Yokochi, Hirofumi Suzuki, Yasuyo Ikegawa, Takeshi Iwata, Takahiro Kudo, Kei Yura, Toshimichi Fujiwara, Takeshi Kawabata, Genji Kurisu, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

  20. CFI 25 subunit of cleavage factor I is important for maintaining the diversity of 3′ UTR lengths in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh

    Plant and Cell Physiology, , 63巻3号(頁369 - 383), 2022年01月, Xiaojuan Zhang, Mika Nomoto, Marta Garcia-León, Naoki Takahashi, Mariko Kato, Kei Yura, Masaaki Umeda, Vicente Rubio, Yasuomi Tada, Tsuyoshi Furumoto, Takashi Aoyama, Tomohiko Tsuge, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

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