論文 - 由良　敬

81. タンパク質の立体構造に基づく相互作用構造の推定

    薬学雑誌, , 128巻11号(頁1547 - 1555), 2008年12月, 由良　敬, 総説, 研究論文（学術雑誌）, 単著

82. Characteristics and prediction of RNA editing sites in transcripts of the moss Takakia lepidozioides chloroplast

    DNA Research, , 15巻5号(頁309 - 321), 2008年12月, Yura, K., Miyata, Y., Arikawa, T., Higuchi, M., Sugita, M., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

83. Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures

    Proceedings of International Symposium on FCS2008, (頁77 - 86), 2008年11月, Yura, K., 総説, 研究論文（大学，研究機関等紀要）, 単著

84. Key interactions in integrin ectodomain responsible for global conformational change detected by elastic network normal mode analysis

    Biophysical Journal, , 95巻6号(頁2895 - 2908), 2008年09月, Matsumoto, A., Kamata, T., Takagi, J., Iwasaki, K., Yura, K., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

85. Correlation between amino acid residues converted by RNA editing and functional residues in protein three-dimensional structures in plant organelles

    BMC Plant Biology, , 8巻(頁79 - ), 2008年07月, Yura, K., Go, M., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

86. Discrimination of class I cyclobutane pyrimidine dimer photolyase from blue light photoreceptors by single methionine residue

    Biophysical Journal, , 94巻6号(頁2194 - 2203), 2008年03月, Miyazawa, Y., Nishioka, H., Yura, K., Yamato, T., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

87. The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts

    Nucleic Acids Research, , 36巻DataBase Issue号(頁D793 - D799), 2008年01月, Genome Information Integration Project and H-Invitational 2 consortium, 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

88. coliSNP database server mapping nsSNPs on protein structures

    Nucleic Acids Research, , 36巻DataBase Issue号(頁D409 - D413), 2008年01月, Kono, H., Yuasa, T., Nishiue, S., Yura, K., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

89. BAAQ: An infrastructure for application integration and knowledge discovery in bioinformatics

    IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, , 11巻4号(頁428 - 434), 2007年07月, Gong, X., Nakamura, K., Yu, H., Yura, K. Go, N., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

90. Toward the elucidation of the pathway of integrin conformational changes

    Modern Scientific Instruments, , Supplementary巻(頁65 - 66), 2006年12月, Goto, J., Yasunaga, T., Nagai, R., Matsumoto, A., Yura, K., Takagi, J., Iwasaki, K., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

91. Amino acid residue doublet propensity in the protein-RNA interface and its application to RNA interface prediction

    Nucleic Acids Research, , 34巻22号(頁6450 - 6460), 2006年11月, Kim, T.P.O., Yura, K., Go, N., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

92. Alternative splicing in human transcriptome: functional and structural influence on proteins

    Gene, , 380巻2号(頁63 - 71), 2006年10月, Yura, K., Shionyu, M., Hagino, K., Hijikata, A., Hirashima, Y., Nakahara, T., Eguchi, T., Shinoda, K., Yamaguchi, A., Takahashi, K., Itoh, T., Imanishi, T., Gojobori, T., Go, M., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

93. Large-scale identification and characterization of alternative splicing variants of human gene transcripts using 56,419 completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs

    Nucleic Acids Research, , 34巻14号(頁3917 - 3928), 2006年08月, Takeda, J., Suzuki, Y., Nakao, M., Barrero, R., Koyanagi, K., Jin, L., Motono, C., Hata, H., Isogai,T., Nagai, K., Otsuki, T., Kuryshev, V., Shionyu, M., Yura, K., Go, M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Wiemann, S., Nomura, N., Sugano, S., Gojobori, T., Imanishi, T., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

94. Coverage of whole proteome by structural genomics observed through protein homology modeling database

    Journal of Structural and Functional Genomics, , 7巻2号(頁65 - 76), 2006年06月, Yura, K., Yamaguchi, A., Go, M., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

95. 全ゲノムを対象とした蛋白質立体構造データベースの公開

    蛋白質核酸酵素, , 50巻(頁2301), 2005年12月, 由良　敬、山口晶太、郷　通子, 総説, 研究論文（学術雑誌）, 第一著者相当

96. Contribution of computational biology and structural genomics to understand genome and transcriptome

    Proc. of the Inter. Symp. on Frontiers of Comp. Sci., (頁75 - 80), 2005年11月, Go, M., Yura, K., Shionyu, M., 総説, 研究論文（大学，研究機関等紀要）, 共著者

97. A grid-based system for integrating bioinformatics applications

    Proc. IADIS Inter. Conf.: Applied Computing 2005, , 1巻(頁551 - 558), 2005年10月, Gong, X.J., Yura, K., Go, N., 原著, 研究論文（大学，研究機関等紀要）, 共著者

98. Sequence analysis of the gliding protein Gli349 in Mycoplasma mobile

    BIOPHYSICS, , 1巻(頁33 - 43), 2005年05月, Metsugi, S., Uenoyama, A., Adan, J., Miyata, M., Yura, K., Kono, H., Go, N., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

99. Newly sequenced eRF1s from ciliates: the diversity of stop codon usage and the molecular surfaces that are important for stop codon interactions

    Gene, , 346巻(頁277 - 286), 2005年02月, Kim, T.P.O., Yura, K., Go, N., Harumoto, T., 原著, 研究論文（学術雑誌）, 共著者

100. タンパク質のフォールディング:自己組織化と遺伝子のスプライシング

     Bionics, , 2巻1号(頁38 - 43), 2005年01月, 郷　通子、由良　敬, 総説, 研究論文（学術雑誌）, 共著者